中國科學院上海有機化學研究所（簡稱上海有機所），是一個歷史悠久、人才薈萃、實力雄厚、設備一流、成果豐碩，在國內外享有較高聲譽和影響的有機化學研究中心；是一個集基礎研究、應用研究和高技術創新研究為一體的綜合性化學研究所，上海有機所創建于1950年6月，是中國科學院首批成立的15個研究所之一，前身是建立于1928年7月的前中央研究院化學研究所。從開展抗生素和高分子化學的研究起步，經過近60年幾代人艱苦創業、奮力拼搏，在以有機化學研究為中心的基礎研究、應用研究與高新技術開發、人才培養等方面均取得令人矚目的成就。在我國“兩彈一星”研制、“人工合成牛胰島素、人工合成酵母丙氨酸轉移核糖核酸”和“物理有機化學中的兩個基本問題：自由基化學中取代基離域參數和有機分子簇集概念”等一批攀登科技高峰的重要成果中，我所科研人員做出了重要貢獻。

1998年上海有機所首批進入中國科學院知識創新工程。從此以多學科交叉為特色，以國家戰略和國民經濟重大問題為導向，以有機化學基礎研究和應用基礎研究為主導，圍繞人口與健康、資源與環境、新材料三大領域，重點突出健康和生命、環境和生態系統、資源利用與開發、新材料、能源開發應用和國家安全等領域中相關的基本有機化學課題等六大研究方向，帶動化學生物學、金屬有機化學、有機合成化學、元素有機化學、物理有機化學、化學信息學、有機材料化學和有機分析化學等八大學科發展。